HUMAIN ET INTELLIGENCE ARTIFICIELLE
L’avenir du développement d’anticorps

L’intelligence artificielle : Une révolution dans la biotechnologie ?

L’Intelligence Artificielle (IA) est en train de remodeler le monde de la biotechnologie, et plus particulièrement le domaine de la conception d’anticorps monoclonaux (mAb). Elle suggère, optimise, prédit. Mais une question demeure : jusqu’où peut-on lui faire confiance pour concevoir l’anticorps idéal ? Et surtout, qui prend la décision finale ?

Conception des anticorps : le duo Humain-IA

Si l’IA apporte des avantages indéniables en termes de vitesse de calcul, de reconnaissance des formes et d’intégration de données à grande échelle, ces outils restent relativement nouveaux et continuent d’évoluer. Leurs modèles prédictifs, bien que puissants, ne sont pas encore assez mûrs pour remplacer la connaissance approfondie du domaine et l’esprit critique des chercheurs expérimentés. L’expertise humaine reste essentielle pour interpréter les résultats obtenus par l’IA, évaluer la pertinence biologique et intégrer les contraintes réglementaires, expérimentales ou spécifiques à l’application que les algorithmes ne peuvent pas entièrement comprendre. Au cours des prochaines années, d’importants efforts d’optimisation et de validation seront nécessaires pour rendre ces technologies plus robustes, plus fiables et pleinement intégrées dans le process de développement des anticorps.

Les plateformes d’IA peuvent être impliquées dans plusieurs étapes d’un programme de développement d’anticorps, essentiellement en tant qu’assistant :

• Sélection des épitopes
• Génération de séquences VH/VL
• Optimisation de l’affinité et de la stabilité
• Prédiction des propriétés de développement et de fabrication

L’IA : un outil brillant, pas un outil autonome

Les modèles d’apprentissage profond fournissent une aide sans précédent : ils permettent de tester rapidement des milliers de combinaisons, d’anticiper les structures secondaires et de réduire les effets « off-target ». Toutefois, la fiabilité de ces modèles dépend des données sur lesquelles ils sont entraînés. Les ensembles de données accessibles au public, bien que vastes, sont souvent incomplets ou biaisés en faveur des résultats positifs, avec une représentation limitée des anomalies expérimentales, des échecs ou des résultats négatifs non publiés – ce que l’on appelle la « littérature grise » sur laquelle les chercheurs s’appuient dans la pratique. Ainsi, les modèles d’IA peuvent manquer des cas marginaux rares mais biologiquement pertinents ou s’adapter de manière excessive à des modèles qui ne se vérifient pas dans tous les contextes biologiques.

Conclusion – L’intelligence humaine, mémoire des échecs silencieux

L’IA modifie la façon dont nous concevons les anticorps monoclonaux, mais elle ne peut pas remplacer l’expertise humaine. Le chercheur n’est pas seulement un décideur : il est le gardien d’une mémoire collective, construite à partir d’expériences ratées, d’artefacts non documentés et d’instincts façonnés par l’expérience et, parfois, par l’échec.
Ce que l’IA ne voit pas – les résultats négatifs oubliés, les signaux faibles d’un projet prématurément abandonné – le scientifique s’en souvient. Il tire des leçons de ce que les modèles, formés uniquement sur des succès documentés, ignorent encore. En bref, l’IA propose. Mais ce sont les humains qui décident.

A propos de BIOTEM

A BIOTEM, nous nous tournons vers l’avenir tout en respectant les fondements de l’excellence scientifique. Forts de 45 ans d’expertise dans le développement d’anticorps et d’immunoessais, nous intégrons l’IA et les plateformes bioinformatiques de pointe avec des méthodologies établies. Cette synergie entre l’expertise humaine et l’innovation technologique nous permet non seulement de répondre à des demandes scientifiques complexes avec précision et fiabilité, mais aussi d’élargir le champ des possibles. En associant une méthodologie rigoureuse à une accélération intelligente, BIOTEM est particulièrement bien placé pour relever des défis de haut niveau, accélérer la découverte et fournir des solutions de pointe pour la recherche, le diagnostic et la découverte de future thérapie.

✅ Conception et sélection d’immunogènes (peptide, protéine recombinante, petite molécule, conjugaison, etc.)
✅ Mise en place d’une stratégie de développement optimisée (hybridome, banque immune par phage display, banque synthétique par phage display, etc.)
✅ Choix des meilleurs outils de criblage et de validation
✅ Ingénierie des anticorps et optimisation des séquences (humanisation, maturation de l’affinité, etc.)

Du design des immunogènes, au développement des anticorps et leur ingénierie, découvrez nos solutions assistées par l’IA

Technologie IHC Peptide Profiler^® de BIOTEM

Notre plateforme exclusive génère des peptides de première classe à utiliser comme immunogènes dans les applications d’anticorps IHC-P (sections FFPE). Grâce à notre puissant logiciel, nous sommes en mesure de modéliser la structure de la cible telle qu’elle est modifiée et de concevoir les peptides candidats. L’étape finale du processus consiste à classer tous les peptides pertinents sur la base de critères IHC-P spécifiques tels que l’immunogénicité et la solubilité par exemple.

Banque synthétique de V_HH Humanisés

Notre banque synthétique exclusive, Quinthetic Library^TM, permet d’obtenir des anticorps très rapidement. Avec un design optimisé pour une diversité focalisée dans des positions spécifiques (CDRs et résidus d’ancrage), la banque a permis d’identifier un large nombre de candidats sur une multitude de cibles. Elle peut être une alternative aux immunisations dans le cas de cibles toxiques, peu immunogènes, très conservées ou correspondant parfois à des fonctions vitales. Avec plus de 87% de succès, nous sommes ravis de proposer notre engagement de résultats ‘No results-No fee’.

Ingénierie d’anticorps et Humanisation

Les anticorps humanisés constituent la majorité des anticorps thérapeutiques approuvés et commercialisés. L’humanisation par CDR-grafting consiste à insérer les régions parentales hypervariables (complementarity determining regions – CDR) d’un anticorps monoclonal « parental » dans la charpente d’un domaine variable d’immunoglobuline humaine acceptrice (framework – FR).

Production d’anticorps recombinants

Une plateforme performante pour la production de vos anticorps recombinants. De la petite à la grande échelle, le système de transfection transitoire est un procédé sans sérum qui offre un rendement de production élevé. Plusieurs backbones, isotypes et formats sont disponibles.

Par Jonathan MAYALI